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一、一般治疗
急性患者应卧床休息，给流质或少渣软食，慢性患者应加强营养，注意避免进食刺激性食物。腹泻严重时可适当补液及纠正水与电解质紊乱。重型患者给予输液、输血等支持治疗。
二、药物治疗
目前常用的抗溶组织内阿米巴药物有硝基咪唑类如甲硝唑、替硝唑、奥硝唑、塞克硝唑和二氯尼特。
1、硝基咪唑类：对阿米巴滋养体有强大杀灭作用，是目前治疗肠内、外各型阿米巴病的首选药物。
2、二氯尼特：又名糠酯酰胺，是目前最有效的杀包囊药物。
3、抗菌药物：可选用巴龙霉素或喹诺酮类抗菌药物。
