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颅骨缺损可由多种病因引起，其中头部外伤是本病最主要的原因，此外，感染、肿瘤、颅骨变形性疾病的手术切除、先天性疾病和外减压术等也可引起本病。
基本病因
1、头部外伤
（1）对重型颅脑损伤患者，行去骨瓣减压术后。
（2）各种原因所致的不能复位的颅骨凹陷性骨折，行扩创术后。
（3）穿透与穿通伤。
（4）小儿闭合性线性骨折。
（5）头皮及颅骨的烧伤和电灼伤。
2、手术
（1）感染、肿瘤及颅骨变形性疾病的患者，需要手术清除病灶，可造成颅骨缺损。
（2）先天性颅裂及外减压术后。
危险因素
1、感染
颅骨骨髓炎可导致颅骨的坏死和缺损，如若进行坏死颅骨清创术，则可造成颅骨缺损。感染所致的颅骨损伤常见于头皮疖痈、外伤性颅骨骨髓炎、头皮血肿、术后感染性颅骨骨髓炎、血源性颅骨骨髓炎、颅内炎症、鼻窦炎性颅骨骨髓炎、结核性颅骨骨髓炎等。
2、肿瘤
如需手术切除病灶，则可造成颅骨缺损。
3、颅骨变形性疾病
临床表现严重者则需进行手术切除变形组织，可造成颅骨缺损。
出现这种情况应该及时的去医院做一个手术，将缺损的地方进行修补，这样可以防止患者出现继发性的脑损害的情况。这段时间一定要待在一个比较好的环境当中，减少一些感染或者是发炎的情况出现，而且要注意观察脑部的情况，如果是做完手术的话，这段时间还要照顾好身体尽量卧床休息。
新生儿房间隔缺损是一种先天性心脏病，属于心脏发育异常的情况，因此是不正常的。这种缺损通常发生在心脏左右两侧的房间隔未能正常闭合，导致血液在心脏内混合。新生儿房间隔缺损的原因可能涉及基因突变、宫内发育不良、遗传因素等多个方面。较小的缺损可能在出生后的一段时间内有自行闭合的可能，对新生儿的影响相对较小。然而，较大的缺损则可能导致心房水平左向右分流增加，影响心肺功能，出现反复呼吸道感染、生长发育迟缓等症状
