婴幼儿腹泻的病因包括多种病原体感染、体质因素、饮食因素、气候因素等。

1、病原体感染

（1）肠道内感染：可由病毒、细菌、真菌、寄生虫引起，以前两者多见，尤其是病毒。

（2）肠道外感染：有时也可产生腹泻症状，如患中耳炎、上呼吸道感染、泌尿系感染、皮肤感染或急性传染病时，可由于发热、感染原释放的毒素、抗生素治疗而并发腹泻。有时病原体（主要是病毒）可同时感染肠道。

2、体质因素

（1）婴幼儿消化系统发育尚未成熟，胃酸和消化酶分泌少，酶活力偏低，但所需营养相对较多，胃肠负担较重。

（2）婴幼儿时期神经调节、内分泌、循环系统、肝功能、肾功能均发育不成熟，调节机能较差。

（3）婴幼儿机体及肠黏膜免疫功能不完善。婴幼儿胃酸偏少，胃排空较快，对进入胃内的细菌杀灭能力较弱；血清免疫球蛋白（尤其是IgM、IgA）和胃肠道分泌型IgA（SIgA）均较低。肠黏膜屏障的免疫防御反应及口服耐受机制均不完善，既容易罹患肠道感染，又容易发生食物过敏相关的腹泻。

3、饮食因素

（1）喂养不当可引起腹泻，多为人工喂养儿，原因为喂养不定时，饮食量不当，突然改变食物品种，或过早喂给大量淀粉或脂肪类食品；果汁，特别是含高果糖或山梨醇的果汁，可产生高渗性腹泻；肠道刺激物（调料、富含纤维素的食物）也可引起腹泻。

（2）过敏性腹泻，如对牛奶或大豆制品过敏也可引起腹泻。

4、气候因素

气候突然变化、腹部受凉使肠蠕动增加；天气过热消化液分泌减少或由于口渴饮奶过多等都可能导致消化功能紊乱引发腹泻。