抽动障碍的发生可能与遗传因素、神经生长因素、器质性因素、心理社会因素、药物因素等有关，医生常通过各项检查推测引发症状的原因。病因的明确对症状的治疗有一定的意义。

1、遗传因素

许多研究表明本病有遗传倾向，双生子发病率也比较高。抽动障碍患儿的一二级亲属中患抽动症、Tourette综合征以及其他精神疾病较正常人群多见，一般认为遗传方式可能是常染色体显性遗传或多基因遗传。

2、神经生长因素

近年来通过神经递质与行为以及精神药物作用机制研究，提示本病与中枢神经递质失调有关，有学者认为本症主要病理变化可能在纹状体多巴胺能系统的靶细胞受体，由于纹状体多巴胺活动过度或是突触后多巴胺受体超敏所致；也有学者认为抽动障碍与去甲肾上腺素及5-羟色胺功能失调有关或是由于脑内γ-GABA的抑制功能降低以致发生抽动。

3、器质性因素

本病神经系统软体征发生率较高，有部分患者脑电图异常，主要为慢波或棘波增加，但无特异性改变。少数病例头颅CT异常。

4、心理社会因素

精神创伤、过度紧张可能诱发或加重抽动症，有人认为母亲孕期遭受某些应激事件，妊娠头3个月反应严重是易致子代发生抽动障碍的危险因素。

5、药物因素

由于长期或大量服用中枢兴奋剂和抗精神病药物，如利他林、匹莫林等可能引起本病。