颌骨骨髓炎的发生与多种因素有关，草绿色链球菌、金黄色葡萄球菌、结核杆菌、梅毒螺旋体等病原体引起的感染以及理化性骨损害，均可引起颌骨骨髓炎，部分颌骨骨髓炎的发病机制尚未完全明确。

1、化脓性颌骨骨髓炎草绿色链球菌和厌氧菌（如普雷沃菌、梭杆菌属和消化链球菌）是骨髓炎的优势菌群，有时也能检出金黄色葡萄球菌。成人及儿童的颌骨骨髓炎多为牙源性感染扩散所致，如根尖周炎、牙周炎和智牙冠周炎的扩散。其次，外伤开放性骨折可造成细菌侵入。还有某些颌骨疾病继发感染导致，如颌骨囊肿、肿瘤、石骨病、骨纤维异常增殖症等。机体抵抗力不佳、细菌毒力较强或颌骨的屏障被破坏的状态下，可能发生感染。

2、婴幼儿颌骨骨髓炎多为金黄色葡萄球菌所致。感染途径可以是局部感染的扩散，如分娩及哺乳期婴儿口腔黏膜或皮肤的擦伤、母体乳腺炎的传染及眼耳鼻感染的扩散等；也可以是血源性感染，如脐带感染、皮肤疖肿等通过血液循环感染。

3、弥散性硬化性颌骨骨髓炎病因和发病机制仍不清楚。可能的病因包括极度活跃的免疫反应、肌肉过劳导致的慢性肌腱骨膜炎及SAPHO综合征（滑膜炎、痤疮、脓疱病、骨肥大症及骨炎综合征）。

4、Garré颌骨骨髓炎Garré硬化性骨髓炎被认为是由于骨膜的过度炎症反应所致。智牙冠周炎、根尖周炎和拔牙后感染是常见病因，但有些病例病因不清。

5、颌骨结核结核菌是在机体抵抗力低下情况下侵入颌骨发病的。结核菌进入颌骨的途径有三种：①身体其他部位的结核通过血液循环侵入颌骨、颧骨等骨松质区域；②口腔软组织的结核菌经溃疡侵犯牙槽突：③结核菌通过拔牙创或牙周袋侵入颌骨。

6、颌骨梅毒由梅毒螺旋体感染所致，常见于第三期梅毒。

7、颌骨放射性骨坏死一般认为放射线、创伤和细菌感染是放射性骨坏死及骨髓炎的三大致病因素。放射线导致骨组织活力的逐渐丧失，处于坏死状态，在此基础上，任何局部创伤（拔牙、手术、黏膜创伤等）和细菌感染（根尖周炎、牙周炎等）都能诱发骨髓炎。

8、颌骨化学性骨坏死某些化学物质超过一定浓度会造成机体细胞和组织的损害。颌骨的化学性骨坏死可见于砷、汞、磷等中毒。