根据患者的病史、典型症状，结合B超、腹部X线、CT、肾盂造影、血常规、肾功能测定等检查，一般可明确诊断。在诊断过程中，还应排除尿道综合征等疑似疾病。

诊断依据

诊断复杂性尿路感染有2条标准，尿培养阳性以及包括以下至少1条合并因素：留置导尿管、支架管或间歇性膀胱导尿；残余尿＞100ml；任何原因引起的梗阻性尿路疾病，如膀胱出口梗阻、神经源性膀胱、结石和肿瘤；膀胱输尿管反流或其他功能异常；尿流改道；化疗或放疗损伤尿路上皮；围手术期和术后尿路感染；肾功能不全、移植肾、糖尿病和免疫缺陷等。

鉴别诊断

1、尿道综合征

常见于女性，有尿频、尿急、尿痛及排尿不适等尿路刺激症状，但多次检查均无真性菌尿。部分可能由于逼尿肌与膀胱括约肌功能不协调、妇科或肛周疾病、神经焦虑等引起，也可能是衣原体等感染造成。

2、肾结核

本病膀胱刺激症状更为明显，一般抗生素治疗无效，尿沉渣可找到抗酸杆菌，尿培养结核分枝杆菌阳性，而普通细菌培养为阴性。静脉肾盂造影可发现肾实质虫蚀样缺损等表现。部分患者伴有肾外结核，正规抗结核治疗有效可帮助鉴别。需要注意的是肾结核常可能与尿路细菌性感染并存，如经抗生素治疗后，仍残留尿路感染症状或尿沉渣异常者，应高度注意肾结核的可能性。

3、慢性肾小球肾炎

尿路感染中的慢性肾盂肾炎患者当岀现肾功能减退、高血压时应与慢性肾小球肾炎相鉴别。后者多为双侧肾脏受累，且肾小球功能受损较肾小管功能受损突出，并常有较明确蛋白尿、血尿和水肿病史；而前者常有尿路刺激征，尿细菌学检查阳性，影像学检查可发现双肾不对称性缩小。

4、全身感染性疾病

急性肾盂肾炎的全身症状明显时易被误诊为流行性感冒、疟疾、脓毒症、伤寒等。但这些疾病有各自的临床特征与实验室检查异常，通过病史询问，注意有无尿路刺激征、肾区叩击痛，结合尿沉渣及尿细菌学检查等可鉴别。