引起胃肠功能紊乱的因素众多，可与生物、精神心理、社会和疾病等因素有关，根据有无生理结构病变，通常将病因分为两类。
1、无生理结构异常：是由生物、精神心理和社会因素共同作用而引起的。如功能性消化不良、肠易激综合征、饮食不规律、工作压力过大等都均可有胃肠功能紊乱的表现。
2、有生理结构异常：常因胃炎、消化性溃疡、胃食管反流、胆囊炎、胰腺炎、胃癌等消化系统疾病引起胃肠功能紊乱。
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胃肠功能紊乱一般都是由生理因素引起的，有可能是心理变化导致的。如果在平时生活中经常吃辛辣刺激性的食物，也会诱发胃肠功能紊乱的情况发生。患者在病情发作的时候就会出现上腹疼痛和烧灼感，有一部分患者也会出现排便困难和粪便干结，严重的就会导致排便不尽感等症状。
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胃肠功能紊乱又叫做胃肠神经官能症。通常在排除人体器质性病变的前提下，精神因素是造成胃肠功能紊乱发生的主要原因，例如工作和生活上的困难、情绪抑郁、紧张焦虑等，都会影响人体正常的胃肠功能，进而诱发胃肠道的功能障碍。
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引起胃肠功能紊乱的原因有很多，一般胃肠的因素比较多见。患者本身有消化系统的疾病，比如溃疡或者急性胃肠炎等这些炎症，或者是溃疡会导致胃肠功能的紊乱。另外，胃肠功能紊乱还可能是饮食因素引起。由于长期不规律的饮食习惯，或者短期内的暴饮暴食；
平时可以多喝一些富含营养成分比较高得州，这样对于改善症状有一定的帮助，最好是清淡一些饮食多吃一些比较容易消化吸收的食物，最好是定时吃饭，这样也能够很好的帮助改善肠胃的情况，也可以去医院做个比较详细的肠胃检查，根据症状服用一些药物调理治疗一下。
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