医生根据病史及临床表现（发热、咳嗽、咳痰），再结合相关辅助检查（如病原学检查、血清标志物检查等检查）可作出诊断。在诊断的过程中，需除外细菌性肺炎、肺结核、肺不张、肺血栓栓塞症等疾病。

诊断依据

1、必须具备以下三项之一才可确诊：

（1）肺组织病理检查，病变组织内可见念珠菌孢子和菌丝，菌丝可侵入组织深层及血管。病变周围有急慢性炎症细胞浸润。

（2）血念珠菌培养阳性同时出现新的肺部炎症表现临床上不能用细菌性肺炎等其他感染解释，痰或支气管分泌物多次连续培养出与血培养相同种属的念珠菌。

（3）经支气管镜黏膜活检见组织内有念珠菌孢子和菌丝，周围有急慢性炎症细胞浸润。

2、疑似病例的诊断需具备以下各项：

（1）宿主因素1项。

（2）有感染性肺炎的临床表现，影像学检查有新出现的局灶性或弥漫性支气管肺炎（口咽部或支气管树下行感染），或细小结节状或弥漫性浸润影（血行播散）。

（3）可排除细菌等其他病原微生物所致肺炎。

（4）合格的痰或支气管分泌物标本反复显微镜检酵母假菌丝或菌丝阳性，以及真菌培养3次或以上为同一种念珠菌生长（血行播散除外）。

（5）血清1，3-β-D-葡聚糖抗原连续2次阳性。

鉴别诊断

1、细菌性肺炎

肺念珠菌病临床表现为外周血白细胞计数、中性粒细胞升高及C反应蛋白升高，与细菌性肺炎类似，常常误诊为细菌性肺炎，但肺念珠菌病影像学表现除了实变影外，多合并结节性病变，确诊需依赖血液、痰液或肺泡灌洗液真菌检查。

2、肺结核

有低热、盗汗等症状，患者可有密切结核接触史，抗结核治疗有效。痰液、支气管肺泡灌洗检查可见结核分枝杆菌。

3、肺不张

肺不张多为痰栓阻塞或肿瘤、肿大淋巴结压迫支气管腔所致。肺不张发生缓慢或其面积小时症状不明显。痰栓阻塞的患者通常发病急，突发胸闷、气急、呼吸困难。合并感染时也可出现咳嗽、脓痰、发热、咯血等症状，与肺炎相似。X线胸片表现肺部密度增高，体积缩小，纵隔向患侧移位，同时也可见原发肿瘤的占位病灶。支气管镜检查对明确肺不张病因有较大的诊断价值。

4、肺血栓栓塞症

肺血栓栓塞症患者常有血栓性静脉炎、心肺疾病、外伤、腹部或骨科手术、长期卧床和肿瘤等病史，具有深静脉血栓形成的高危因素。患者如突发剧烈胸痛、咯血、呼吸困难、神志不清时应高度怀疑肺血栓栓塞。X线胸片示区域性肺纹理减少，典型改变出现尖端指向肺门的楔形阴影。通过详细的询问病史及影像学检查，不难作出鉴别。

1、根据病变部位分类

（1）支气管炎型：病变累及支气管及周围组织，但未侵犯肺实质，影像学检查显示肺纹理增多、增粗、模糊。

（2）肺炎型：念珠菌入侵肺泡，引起肺实质急性、亚急性或慢性炎症改变，影像学显示支气管肺炎或叶段肺炎的征象。

2、根据感染途径分类

（1）原发（吸入）性念珠菌肺炎：指发生并局限于肺部的侵袭性念珠菌感染；部分患者亦可发生血性播散。

（2）继发性念珠菌肺炎：指念珠菌血流感染血行播散引起的肺部病变。

（3）其他类型：如过敏性、肺念珠菌球和念珠菌肺空洞等特殊类型。