根据患者的病史、症状，再结合流行病学及相关的检查，多可进行诊断。病原学检查检测到乙脑病毒抗原、特异性核酸者可确诊。
流行性乙型脑炎是由乙脑病毒感染引起的一种脑膜炎症。流行性乙型脑炎主要是通过被蚊虫叮咬后传染。主要临床症状表现为急性起病，高热，意识障碍，惊厥等。流行性乙型脑炎是一种中枢神经系统急症，需要住院进行治疗。可以给予适当的抗病毒治疗，支持对症治疗。
HPV即人乳头瘤病毒。一般情况下，传染性软疣并不是人乳头瘤病毒，两者在感染途径、所致疾病、临床表现等方面都存在明显的不同。传染性软疣是由传染性软疣病毒感染所致的一种皮肤病，这种病毒属于痘病毒科，与HPV病毒在分类上存在显著差异。人乳头瘤病毒主要引发的是生殖器疣、寻常疣、扁平疣等皮肤病变，以及某些类型的癌症，如宫颈癌、肛门癌等。而传染性软疣则主要表现为皮肤上出现半球状的丘疹，表面呈蜡样光泽，中间呈脐窝状，可以挤出乳酪状软疣小体，多见于儿童以及免疫力较差的人群
