1、代谢异常

形成结石的成分大多是由人体代谢产物构成，不同成分的结石可以反映体内相应成分的代谢异常。尿液内常见的能够形成结石的成分包括钙、草酸、尿酸和胱氨酸等，任何生理紊乱造成成分异常都可能引起结石形成和促进结石生长。常见的能够引起代谢产物异常的原因有：

（1）形成结石的物质排出增加：长期卧床或甲状旁腺功能亢进者尿钙增加；痛风病人尿酸排出增多；内源性合成草酸增加或肠道吸收草酸增加引起高草酸尿症；家族性胱氨酸尿症病人胱氨酸排出量增加。

（2）尿pH改变：在碱性尿中易形成磷酸镁铵及磷酸盐沉淀；在酸性尿中易形成尿酸和胱氨酸结晶。

（3）尿中抑制晶体形成和聚集的物质减少：当尿液中抑制结石的物质（如枸橼酸、焦磷酸盐、酸性黏多糖镁等）产生不足，会促进结石形成。

（4）尿量减少：患者的尿量减少，会导致尿中盐类和有机物质的浓度增高。

2、局部病因

尿路梗阻、感染和尿路存在异物均是诱发结石形成的局部因素，梗阻可以导致感染和结石形成，而结石本身也是尿路异物，后者会加重梗阻与感染的程度。

3、药物因素

一些药物的使用，同样可能引起结石，相关的药物分两类：

（1）尿液的浓度高而溶解度比较低的药物：如氨苯蝶啶、茚地那韦、硅酸镁和磺胺类药物等，这些药物本身就是结石的成分。

（2）诱发结石形成的药物：如乙酰唑胺、维生素D、维生素C和皮质激素等，这些药物在代谢过程中可引起其他成分结石的形成。