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低磷血症的病因主要包括磷摄入与吸收减少、尿磷丢失过多、磷酸根离子转入细胞内。其中，尿磷丢失过多和磷酸根离子转入细胞内所导致的低磷血症较为常见，而单纯由于磷摄入不足者比较罕见。
1、磷摄入与吸收减少
（1）低磷饮食：正常人单独依靠饮食缺乏是不会发生低磷血症的。但只靠母乳喂养的新生儿，如果母乳不能满足其生长需要，则可能出现低磷血症。另外，饥饿患者单独给予糖类饮食、单独给予母乳喂养的早产儿、长期低磷饮食等情况，也会造成低磷血症。
（2）维生素D缺乏：体内维生素D缺乏时，会导致肠道吸收钙、磷减少，从而引起低磷血症。
（3）长期应用抗酸制剂：一些抗酸制剂，如氢氧化铝、氢氧化镁、碳酸钙等，会在肠道中与磷酸盐结合，影响磷的吸收，从而引起低磷血症。
（4）其他因素：反复的呕吐、腹泻，以及吸收营养不良综合征等，也会导致磷吸收减少，从而引起低磷血症。此外，约半数的急性/慢性酒精中毒患者也会出现低磷血症。
2、尿磷丢失过多
（1）原发疾病：一些常见的原发疾病，如慢性代谢性酸中毒、范可尼综合征、甲状旁腺功能亢进、糖尿病酮症酸中毒等，均因肾小管对磷的重吸收发生障碍，从而导致尿磷增多，血磷减少。
（2）长期使用利尿药：长期使用利尿药，如碳酸酐酶抑制药（乙酰唑胺）、碳酸氢盐、甘露醇等，均可导致尿磷排泄增多，从而导致低磷血症。
（3）激素：快速输入糖皮质激素可使尿磷排泄增加，糖皮质激素还可减少胃肠道磷的吸收。另外，雌激素也可导致肾排磷的阈值降低。
（4）家族性低磷血症：是一种X连锁显性遗传疾病，患者会出现低磷血症和维生素D抵抗性佝偻病。这是由于先天性肾小管缺陷所致，并伴有肠管吸收障碍。
（5）肾移植：肾移植术后由于细胞外液量增加而导致肾小管重吸收减少，并且免疫抑制药、抗酸制剂的使用等多种因素，会进一步造成血磷降低。
（6）其他因素：如痛风、急性肾功能衰竭多尿期，因肾脏损害，引起磷从肾脏排出增加而发生低磷血症。
3、磷酸根离子转入细胞内
（1）碱中毒：呼吸性碱中毒是导致住院患者出现低磷血症最常见的原因之一。比如，败血症、脓毒血症、热休克、烧伤等均会导致患者出现呼吸性碱中毒。而且，呼吸性碱中毒常引起急性低磷血症，患者症状较为严重。另外，代谢性碱中毒也可造成低磷血症，病情较呼吸性碱中毒轻。
（2）糖负荷增加：葡萄糖会刺激胰岛细胞分泌胰岛素，而胰岛素可使磷向细胞内转移，从而造成低磷血症。
（3）内分泌激素：糖尿病酮症酸中毒患者，在胰岛素治疗后，可引起急性低磷血症。除胰岛素之外，其他一些内分泌激素，如胰高血糖素、肾上腺素、蛋白同化激素，也可促使磷向细胞内转移。
（4）其他因素：如白血病、营养恢复综合征患者，也会因磷向细胞内转移，而造成低磷血症。
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