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医生会询问患者异常症状出现的时间以及病情的变化情况，询问患者既往有无腹腔脏器疾病经历，结合患者的临床表现以及血常规、C反应蛋白检查、尿常规、血气分析、血生化、凝血功能检查、X线、CT、B超、诊断性穿刺等辅助检查结果综合进行诊断。
依据术后是否需要使用抗菌药物，可以将腹腔感染分为单纯性腹腔感染与复杂性腹腔感染。一般并不需要给予抗菌药物（除术前预防性应用抗生素）的腹腔感染为单纯性腹腔感染；在控制感染源后，仍需使用抗菌药物治疗残余感染的为复杂性腹腔感染，如阑尾脓肿或阑尾炎伴穿孔的腹腔感染。
