主要是通过结膜细胞学检查、衣原体分离培养、分子生物学检查、原位杂交法检测等进行诊断。
我国把沙眼分为三期，一期即进行活动期，二期又称退行期，三期亦称完全瘢痕期。
眼科 马鞍山市人民医院
沙眼病原体是一种衣原体，介于细菌和病毒之间，被称为沙眼衣原体。在卫生条件差的流行地区，反复感染很常见。原发感染导致结膜组织对沙眼衣原体敏感，当它遇到沙眼衣原体时，可引起迟发型超敏反应。这可能是沙眼急性发作的原因和反复感染的表现。随着生活水平的提高，沙眼的发病率已大大降低。
如何检查沙眼
1.病原体检测
（1）涂片检测衣原体包涵体是最常用的筛选方法，可用于筛查高危人群。
（2）细胞培养方法被认为是检测沙眼衣原体的金标准，但它耗时并且需要一定的设备技术条件。
2.分子生物学方法
眼科 广州医科大学附属第一医院
沙眼是结膜炎的其中一种，它是因为感染了沙眼衣原体，导致的结膜炎其中一种。沙眼是会传染的，它在50年代的国内是所谓的致盲眼病。因为当时的医疗条件和卫生条件都不好，可能一家人用一个脸盆，或者一家人用一条毛巾，这种情况是最常见的，此时沙眼就很容易传染，而且是接触传染。一般全托的小童，或者是住宿舍的一些学生是比较容易互相传染。假如注意个人卫生，脸盆、毛巾专人专用还是可以避免的。因为本身是接触传染的，只要切断传染途径，就可以很好地控制。
考虑可能是由于结膜炎角膜炎，还有就是视疲劳维生素或者是微量元素缺乏所引起的症状。建议可以使用抗感染的眼药水进行治疗一下。要注意眼部的金钱和卫生，注意锻炼身体增强体质，可以多吃些新鲜的蔬菜和水果，避免刺激性的食物，适当的补充维生素和微量元素。
面带忧虑的患者走进诊室，向我咨询一个颇为敏感的问题：医生，我听说正常夫妻也有可能感染沙眼衣原体，是真的吗？我和丈夫都很担心，怕不小心感染了。我安慰道：别担心，沙眼衣原体确实是一种常见的病原体，但正常夫妻之间并不是一定会感染。我继续解释说：沙眼衣原体主要通过性接触传播，但并不意味着每对夫妻都会感染。只要双方保持健康的生活习惯，注意个人卫生，感染的风险是可以大大降低的😊。患者听后稍微放松了一些，但仍有疑虑：那我们怎么才能确定有没有感染呢
