根据类型不同，临床表现也不相同。肺炎衣原体感染可有咳嗽、发热表现。沙眼衣原体感染根据侵犯部位不同，临床表现多样。鹦鹉热可有畏寒、发热、头痛及明显肌痛等表现。

典型症状

1、肺炎衣原体感染

肺炎衣原体感染的临床表现轻重不一，可从无症状到重症肺炎，儿童及青少年患者病情一般较轻微而不及时诊治，会导致病情迁延致慢性咳嗽。成人，特别是有慢性疾病基础或重复感染的老年人，病情较重且可能会合并其他感染，主要的症状还是低热以及咳嗽。

2、沙眼衣原体感染

沙眼衣原体感染以沙眼、鼻咽部、子宫颈、尿道及直肠黏膜部位的症状为主，一般可无明显全身症状，严重及反复感染者会导致严重后果。

（1）沙眼：早期表现为流泪、分泌黏液脓性物、结膜充血等。后期病程迁延数年或数十年移行为慢性，损害角膜影响视力，最后导致失明。

（2）包涵体结膜炎：表现为滤泡性结膜炎，可伴耳前淋巴结肿大。本病可致角膜炎、角膜混浊，很少出现角膜血管翳及结膜瘢痕，罕见永久性视力损害。

（3）泌尿生殖道感染：男性感染主要表现为尿痛、尿道口瘙痒、刺痛或烧灼感，尿道可有少量浆液性稀薄分泌物，尿道口红肿。女性感染导致尿道炎时可表现为尿频及排尿困难等症状。

（4）性病淋巴肉芽肿：临床表现为生殖器丘疹，伴溃疡改变，多数出现腹股沟淋巴结肿大。反复发作可致尿道狭窄。

（5）新生儿感染：可出现眼睑及结膜充血、肥厚、乳头肥大，有脓性分泌物等。出生1周后还可能会出现肺炎，表现为重复发生的短促咳嗽和呼吸窘迫。

3、鹦鹉热

潜伏期一般为7~14日，起病隐匿，以畏寒、发热、头痛及明显肌痛为常见症状，特别是颈及背部肌痛显著，关节痛亦可见。患者还可有食欲不佳、恶心及呕吐等消化道症状。同时近年来也有一部分报道显示患者会有严重的腹痛症状。

并发症

1、附睾炎

附睾炎是男性生殖道沙眼衣原体感染的主要并发症。它的主要症状是附睾肿大、发硬且有触痛，如累及睾丸时可出现疼痛、触痛、阴囊水肿和输精管变粗等，还可并发前列腺炎，有后尿道、会阴和肛门部位的重坠和钝痛，可产生性功能障碍。

2、不孕或异位妊娠

女性生殖道沙眼衣原体感染若不及时治疗，衣原体上行感染侵犯输卵管黏膜，会导致输卵管黏膜破坏，粘连，输卵管不通，从而导致不孕或异位妊娠。