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治疗原则
重点是针对主要症状进行治疗。对于临床表现各不相同的患儿，依据其可能存在的发病机制进行整体治疗，选择个体化方案，目的在于迅速缓解症状，提高生活质量。
药物治疗
根据患儿的临床表现及其与进餐的关系，可选用促动力药、抗酸药和抑酸药，一般疗程2-4周，治疗无效者可适当延长疗程，并可进一步检查，明确诊断后再进行治疗。研究提示Hp根除治疗对患者症状的改善是有益的，所以有Hp感染者，需进行Hp的根除治疗。
1、促动力药
（1）多巴胺受体拮抗剂：多潘立酮是选择性外周多巴胺D2受体拮抗剂，不能透过血脑屏障，因而无椎体外系不良反应，主要作用是增加胃窦和十二指肠动力，促进胃肠排空，可明显改善患儿餐后腹胀、早饱等症状。但需要引起注意的是长期使用可导致血泌乳素升高，个别患者可能出现乳房胀痛或泌乳现象。
（2）5-羟色胺（5-HT）受体激动剂：如枸橼酸莫沙必利，可明显改善患者腹胀、早饱等症状，增强胃肠道蠕动作用以促进胃肠排空。
2、抗酸及抑酸药可明显缓解腹痛、反酸、烧心等症状，适用于餐前有症状而餐后加重的患儿。目前常用的抗酸药有铝碳酸镁、复方氢氧化铝、碳酸钙口服混悬液等；常用的抑酸药有质子泵抑制剂（奥美拉唑、泮托拉唑、埃索美拉唑等）、H2受体拮抗剂（如西咪替丁、雷尼替丁、法莫替丁等）。
3、根除Hp感染药物包括抗生素（如阿莫西林、甲硝唑、呋喃唑酮）、质子泵抑制剂以及胃黏膜保护剂（如胶体果胶铋）。对于合并有幽门螺杆菌感染的患儿，在治疗幽门螺杆菌后，症状可以得到明显改善。
4、抗焦虑、抗抑郁药对于促动力药和抑酸药治疗无效且伴有明显精神心理障碍的患儿，可以在心理科医生协助诊治的情况下，适当使用抗焦虑、抗抑郁药来改善症状。
其他治疗
1、改善患儿生活方式，调整饮食结构和习惯，去除与症状相关的可能发病因素，有助于缓解症状。
2、对存在心理问题的患儿进行心理疏导，给予一定的行为治疗、认知治疗或心理干预，同时可以配合使用一些安慰剂，随着时间的推移大部分症状可改善。
小儿功能性消化不良的情况可以服用一些消食片和益生菌来进行调理肠胃，同时要注意饮食习惯，少吃多次，选择易消化的食物为好的，也是要注意避免着凉了，增加营养，是有利于治疗现在的情况，适当的活动身体，按摩腹部，是有利于治疗消化不好的情况，加快肠蠕动。
燕窝果性质偏凉，属于凉性水果，但具体寒性程度因人而异，体质偏热者适量食用可清热降火，体质偏寒或脾胃虚弱者过量食用可能引发不适。燕窝果的凉性特质源于其性味归经属性。中医认为，燕窝果性味甘、酸，归肺、胃、大肠经，具有清热降火、润肺止咳、生津止渴的功效。其凉性可中和体内热邪，缓解热病口渴、烦躁等症状，适合体质偏热或夏季食用。然而，凉性食物易伤阳气，若体质偏寒（如手脚冰凉、畏寒怕冷）或脾胃虚弱（如易腹泻、腹胀）者过量食用，可能加重体内寒气，导致胃痛、胃胀、腹泻等不良反应
