在我国，感染是导致小儿肝硬化的主要病因，先天性胆道梗阻以及先天性代谢缺陷和遗传病也为常见病因。除此以外，毒物及药物中毒、免疫异常、肝脏淤血及其他原因也会导致肝硬化。

1、感染

病毒、细菌、真菌及寄生虫感染肝脏后会逐渐进展为肝硬化。我国小儿中最常见的类型为乙型肝炎病毒或丙型肝炎病毒感染引起。另外，巨细胞病毒、风疹病毒、单纯疱疹病毒宫内感染，以及先天梅毒均易侵犯肝脏；晚期血吸虫病、华支睾吸虫病、弓形虫病及疟疾等寄生虫病也会引起肝硬化；细菌中毒性肝炎中若伴有金黄色葡萄球菌败血症，或免疫力低下的1岁以下婴儿伴营养不良，或伴有病毒性肝炎时容易发展为肝硬化。

2、遗传性或先天性代谢缺陷

某些酶的缺陷使酯、氨基酸、脂肪或金属微量元素铜、铁等贮积肝脏会导致肝硬化。常见的有肝豆状核变性、α1-抗胰蛋白酶缺乏症、酪氨酸血症、半乳糖血症、糖原贮积症Ⅳ型、遗传性果糖不耐受症、范科尼综合征、戈谢病等。脑肝肾综合征是少见的常染色体隐性遗传病，可表现为肝硬化。含铁血黄素沉着症和血色沉着症也可发展为肝硬化，但较罕见。

3、毒物及药物中毒

砷、磷、铋、氯仿、异烟肼、辛可芬、毒蕈等中毒损伤肝脏，可引起肝硬化。

4、免疫异常

可引起自身免疫性肝炎，后期会逐渐发展为肝硬化。

5、肝及胆管囊性疾病

先天性肝纤维化、先天性肝内胆管扩张症、先天性肝总管囊肿等发展至后期都会出现肝硬化。

6、肝脏淤血

由于肝静脉血管畸形、血栓形成、慢性充血性心力衰竭、慢性缩窄性心包炎造成长期肝淤血会导致肝硬化。

7、其他原因

还有一部分无法确定病因，如印度儿童肝硬化、家族性肝硬化等。