颞下颌关节紊乱综合征的病因复杂，无法用一种机制解释清楚，致病因素主要有咬合因素、肌群功能紊乱、精神心理因素、创伤因素、关节负荷过重因素如夜磨牙和白天紧咬牙、炎症免疫因素、关节解剖因素，此外，寒冷刺激、不良姿势、不良习惯等都与颞下颌关节紊乱综合征的发病有关。

1、咀嚼肌紊乱疾病外伤、微小创伤、精神紧张、寒冷刺激、紧咬牙、夜磨牙等可导致咀嚼肌的直接受损。开口过大或因口腔科治疗等需长时间大张口，可导致咀嚼肌过度活动。

2、结构紊乱疾病主要是颞下颌关节盘移位，尤其是颞下颌关节盘前移位。颞下颌关节盘前移位的病因不明，许多学者认为与损伤有关，如车祸、长时间大张口、磨牙症、紧咬牙、偏侧咀嚼、经常进食硬物等。精神紧张、咬合关系紊乱、后牙缺失、髁突发育异常以及骨关节病等也与关节盘前移位有关。打呵欠唱歌、大笑、呕吐、大张口进食等可使关节半脱位，家族遗传性关节囊松弛，心理因素以及服用某些药物等也可导致关节半脱位。

3、炎性疾病颞下颌关节滑膜炎可分为原发性与继发性两种。原发性滑膜炎病因不明，多出现在类风湿关节炎等疾病中。继发性滑膜炎多由外伤、微小损伤、关节邻近组织的炎症、感染、关节盘移位、骨关节病以及自身免疫反应等因素所致。

4、退行性关节病（包括骨关节病和骨关节炎）退行性关节病的主要病因，如关节持续承受异常压力、咬硬物、偏侧咀嚼、磨牙症、紧咬牙、外伤、车祸、下颌受到外力打击等使关节表面软骨受到破坏，从而导致关节退行性变发生。咬合关系紊乱也可导致关节退行性变。