霉菌性龟头炎是指包皮与龟头的弥漫性炎症。阴茎包皮容易藏污纳垢，因此常常导致细菌或真菌的感染。主要症状有阴茎包皮及龟头的潮红、丘疹，自觉瘙痒、烧灼感，但并不影响正常的泌尿、生殖功能。该病好发于20～50岁之间的青壮年，包皮过长或包茎者易发，待炎症控制后应尽早进行包皮环切术。
急性前列腺炎是指由细菌引起的前列腺组织的急性炎症。临床症状为常突然发病，多数患者可出现全身感染中毒症状，包括突然发热、寒战、肌肉关节疼痛和全身不适，并可出现恶心、呕吐、厌食等。急性细菌性前列腺炎会造成尿潴留、膀胱炎、性功能障碍，严重影响泌尿、生殖等系统功能，需要及时治疗。
射精障碍是指男性会出现精疲力竭的情况导致早泄、精疲力竭和逆行射精。射精障碍是一种指男性精液在兴奋性高潮中无法将精液充分排出的病理状态。在性功能障碍中，射精障碍在男性中最为常见，射精障碍给许多男性朋友的性生活和日常生活带来了严重的问题，频繁的进行夫妻生活或双层避孕套可能会降低阴茎的敏感性，导致射精障碍。
龟头炎指龟头黏膜的炎症性疾病，包皮炎指包皮及其黏膜面的炎症性疼痛疾病。由于龟头及包皮感染常同时存在，故统称为龟头包皮炎。本病的主要特征为龟头及包皮内侧的红肿、疼痛和瘙痒。严重侧糜烂化脓或者存在浅表溃疡，可能存在排尿痛。患者多有包茎或包皮过长史，以及外伤、尿道感染或不洁性交病史。
急性附睾炎为附睾的非特异性感染，是阴囊内最常见的感染性疾病。本病由后尿道炎、前列腺炎和精囊炎沿输精管逆行感染所致。急性附睾炎常继发于前列腺炎。阴囊内疼痛常突然发生，可沿精索放射至腹股沟区及腰骶部，疼痛通常较重，触痛明显拒按，肿胀进展较快。该病可影响泌尿、生殖系统，影响性功能，出现焦虑等精神病变。
龟头瘙痒一般由于包皮龟头炎等生殖器感染引起，可伴有疼痛、流脓。严重者有乏力、低热、腹股沟淋巴结肿大及压痛等。该病主要由感染引起，感染常因不洁性交，感染白色念珠菌、滴虫、衣原体、支原体、淋病双球菌或其他细菌引起。非感染因素大多由包皮过长，清洁不够，包皮和龟头之间的不洁之物，即包皮垢堆积起来，刺激局部的包皮和黏膜发生炎症引起。
勃起功能障碍(ED)是男性性功能障碍最常见的疾病形式。勃起功能障碍是指男性阴茎没有能力达到或足以维持一个双方满意的性生活(性交)。这种疾病通常也被称为“阳痿”，即阴茎无法持续勃起或者难以达到或维持足够的勃起从而进行性生活。男性“阳痿”的原因有很多，但是患者通常不愿承认自己患病。因为外界对这种疾病的理解是是不精确和歧视性的。
隐睾是指儿童在发育时期出现的一种不健康状态导致的病变，患者在发育时期睾丸未下降至阴囊，这种情况包括睾丸下降不全和睾丸异位。临床上绝大多数隐睾为睾丸下降不全。异位睾丸最常位于腹股沟浅表小窝内。80％的隐睾可被触及，20％不可被触及，大约20％不可触及睾丸是睾丸缺如，30％是睾丸萎缩。
前列腺痛是指尿道肌和前列腺肌或盆底肌痉挛性疼痛，并非感染性疾病。主要见于20～45岁的男性。临床表现为腹部、会阴、腰骶或睾丸等部位疼痛或不适，伴有尿急，排尿障碍。严重病变者可因排精、排尿、排便而明显加重，甚者伴有射精痛。前列腺痛的治疗比较困难，确诊后也缺乏特效疗法。
慢性附睾炎常由急性附睾炎治疗不彻底演变而成。附睾可有不同程度的增厚及肿大并可有硬节，局部轻度压痛，与睾丸分界清楚。精索及输精管增粗。另外有阴囊疼痛、坠胀感，疼痛可放射至下腹部及同侧大腿内部。可伴前列腺变硬。青年多见，病程较长，较难治愈。一般不影响健康，双侧慢性附睾炎可导致男性不育。
射精痛是指男性在性交达到高潮时，射精前后过程中发生的阴茎、尿道、睾丸、会阴部、下腹部或阴囊上方等处任何一个部位会出现疼痛或者隐痛的情况。该病多为阵发性酸痛或隐痛。通常该病是由感染而引起，如精囊炎、前列腺炎、后尿道炎等炎症，另外在射精时动作过于粗暴也会引起射精痛。
指男性特有生殖器位——睾丸的阴茎皮肤和阴茎头发生一定的错位覆盖，包皮是阴茎皮肤过多覆盖阴茎头出现双层褶皱，而包茎指是包皮口过于狭窄不能上翻露出阴茎头。包皮过长或包茎都会导致包皮污垢积累易导致包皮炎，使包皮口形成瘢痕性挛缩。进而影响泌尿系统，导致尿潴留。前期可以自我治疗按时清洗。后期依然经常发生包皮炎症要及时进行外科手术。
小阴茎指阴茎的长度与周径短而小，成年时阴茎长度不足3cm，与年龄和发育期不相符。临床多伴有生殖功能低下及垂体和松果体功能不全，睾丸、阴囊和前列腺均较小。原因可能是在外生殖器发育过程中性腺缺少睾丸酮分泌所致。可为先天性 (如单侧性腺发育不良或染色体异常)或后天性 (如感染、损伤或胎睾扭转等)。
双阴茎又叫重复阴茎为两个阴茎，常并发其他畸形如尿道上下裂开、膀胱外翻，可分为部分重复阴茎和完全性重复阴茎两种类型。胚胎发育中受特异环境或遗传因素的影响，导致泄殖腔膜的纵行重复。患者临床表现为有排尿、性交障碍，有时有两个尿道，一个在正常位置，另一个在非正常位置且发育小。通常通过手术切除来治疗。
前列腺增生症是老年男性常见病。多于50岁以后发病，与性激素平衡失调有关。病理改变主要为两侧叶及中叶前列腺组织及上皮增生。该病的临床表现为： 进行性排尿困难、尿频、尿急、尿失禁、急性尿潴留、血尿、肾功能不全等症状。直肠指诊可摸到肿大的前列腺，B型超声检查有助诊断。
良性前列腺增生是指男性进入老年期后由于体内性激素平衡失调而引起前列腺腺体的良性增生性病变。增生腺体压迫后尿道，导致下尿路梗阻，并由此产生一系列病理生理改变。良性前列腺增生的早期由于代偿，症状不典型，随着下尿路梗阻加重，症状逐渐明显，临床症状包括储尿期症状，排尿期症状以及排尿后症状。
阴茎折断是指阴茎在勃起状态下，由外在暴力而引起的阴茎海绵体的白膜破裂，又称为阴茎海绵体破裂。阴茎勃起时，血管窦充血，内压增加，白膜变薄仅为0.2～0.25毫米，极易受垂直外力、甚至是轻微外力作用下导致白膜及海绵体破裂。如性交失误致使阴茎撞于女方耻骨联合或会阴部，或手淫扳折阴茎都有可能致伤。
阴囊肿大是指具有阴囊一侧或两侧体积增大，皮肤皱褶减少特征的病症，或邻近组织等多种疾病的征象。病因可能为急慢性炎症、本身器质性改变、寄生虫侵入、肿瘤等使阴囊出现病理性肿胀，或炎性渗出增加，出现水肿积液等。通常具有此征的常见于以下疾病：阴囊血肿、象皮肿、阴囊炎症、脓肿、肿瘤，鞘膜积液等。
睾丸结核是男性生殖系统结核的一种，绝大多数是继发于泌尿系结核病，如肾结核、前列腺、精囊、输精管、附睾结核相互蔓延而发病。睾丸结核的主要临床表现，除一般的结核中毒症状、全身乏力、低热外，局部为睾丸轻度疼痛，隐痛下坠感，早期不易确诊，少数急性发病。可表现为睾丸肿大，疼痛明显，睾丸肿大，同时病人还伴有尿频、尿急、性欲功能低下、阳痿、遗精、早泄等表现。
男性性功能减退一般是指男子具有遗精、早泄、阳痿等症状的疾病。遗精是指不因性生活而精液遗泄的病症，甚至清醒时精液流出者，称为滑精；阳痿即阳事不举，是指同房时，男性生殖器举而不坚或痿软失用；早泄是指性交时，男方不能持久，一触即泄。性功能低下的主要原因与大脑皮层有关，常见于性神经衰弱症。
左精索静脉曲张是由于不同的多种原因而引起的男性精索静脉中血液回流受阻，导致血液淤积，造成精索静脉蔓状静脉丛扩张，在阴囊中形成多个团块状的肿大。左精索静脉曲张主要好发于青壮年男性，主要以左侧静脉曲张最为多见,发作时疼痛难忍，会阴部疼痛感最为剧烈，呈放射状疼痛，在端坐时最为明显。
慢性细菌性前列腺炎是泌尿系常见疾病，主要由经尿道的逆行感染引起。多见于青少年，常见致病菌为大肠埃希菌、沙雷菌属、克雷伯菌属等。慢性细菌性前列腺炎有反复发作的下尿路感染症状，如尿频、尿急、尿痛、排尿烧灼感、排尿困难、尿潴留、后尿道肛门会阴区坠胀不适，持续时间超过3个月。
阴茎整形是指通过整形手术的方法对男性生殖器官进行形状和功能的修复和改善。相对来说进行过整形手术比没有进行过整形手术的生殖器官更不容易发生尿路感染。进行阴茎整形手术后能够有效减少包皮细菌的黏附，减少泌尿系统细菌感染的发生率。阴茎整形的技术创伤小、手术过程不需缝线，危险较小。
非细菌性前列腺炎，在临床上又称为“无菌性前列腺炎”，即患者出现没有细菌感染而是有其他因素引起的一类前列腺疾病。此病主要发生在男性患者身上。临床上的发病机制可能的病原体有解脲脲原体和沙眼衣原体。有前列腺炎的症状，但前列腺液内无细菌生长，前列腺液的改变与细菌性前列腺炎相同。严重者还会危及患者其他部位的身体健康。
阴茎结核是泌尿生殖道结核病变的一种。结核病变可以发生在阴茎的皮肤表面，也能发生在阴茎的海绵体结构，或者发生在尿道内。引起结核病变的主要原因是结核杆菌侵入人体，结核杆菌可能是由于其他组织器官发生病变，通过血行传播而引发的疾病，也可能是由于性生活不卫生或者性伴侣有结核病感染导致的。
非特异性尿道炎是尿道炎症反应的一种特殊类型。本病与细菌感染人体有关，细菌感染主要与不干净不卫生的生活习惯有关，另外本病也与性生活不卫生有很大的关系，常常在性生活过后几天，尿道会出现黏液性或者浆液性的脓性分泌物流出，并且在小便时会伴随有剧烈的疼痛。主要致病菌为大肠杆菌。
蹼状阴茎指的是患者阴囊中缝皮肤和阴茎腹侧皮肤发生连接，造成阴茎和阴囊不能全面分离。这种疾病大多都属于先天性畸形，也有部分是因为后期的包皮环切术恢复不彻底导致的。绝大部分患者的尿道发育正常，并且儿童患者除了外观异常外，并不会导致其他症状出现，但是成年后会造成患者性交困难。
睾丸损伤，即男性患者由于外部或内部等因素造成的一类睾丸损伤的病症。阴囊及其内容物的损伤临床上并不少见。一般多发生于青壮年。往往同时出现睾丸、鞘膜、精索及阴囊壁的损伤，常见的致伤原因多为直接暴力。2、局部剧痛：痛感可放射至下腹部，腰部或上腹部，甚至可发生痛性休克，疼痛时还可伴有恶心，呕吐症状。
男性更年期综合症一般是指男子在50岁～60岁之间因性腺发生退变而导致的一系列临床症候。主要致病原因包括睾丸的内分泌功能及精子生成能力自然衰退、因睾丸本身病变、全身严重疾病引起睾丸内分泌功能及精子生成功能障碍等。临床主要表现为情绪不稳、失眠、头痛、高血压、心悸，性欲减退进而阳萎等。
男性生殖器畸形，即男性生殖器部位出现不同程度的畸形表现的一类病症。此病大多数是属于先天性疾病，多由各种因素导致的男性胎儿基因表达异常。主要临床表现为睾丸畸形，如睾丸数量、位置异常等，输精管畸形，阴茎异常，如阴茎完全缺失多合并尿道畸形，先天性阴茎扭转，尿道上裂和下裂等。