治疗原则
由于引起男性不育症的原因比较多，针对不同原因引起的不育，治疗方法不同。及时去医院就诊，查明病因，医生会根据患者的病因、不育时间、生育需求等推荐最适合的治疗方案。部分疾病如精索静脉曲张或输精管梗阻需要手术解决。某些常规手段不能改善者需行辅助生殖技术。
对因治疗
应避免可能引起不育的不良因素：
1、避免不良环境因素
有许多不育症是由于环境因素影响了睾丸的生精功能，如接触放射线化学产品和重金属及高温作业等敏感的人很快可以使生精细胞受到损伤，而使精子无法生成。若证实确系此类原因造成，那么应及早脱离接触或注意防护，可以使原有损伤恢复。长期不予警惕，听之任之，等达到不可逆转的程度就难以治愈。
2、避免吸烟、大量饮酒和饮用咖啡
不育症患者应尽量避免吸烟和大量饮酒，因为大量吸烟会增加精液中硫氰酸的含量，可抑制精子的活动力。吸烟人群精液中畸形精子的数目也都明显髙于不吸烟者。酒中所含的乙醇（酒精）对睾丸也是有害的，长期过量地饮酒，可使体内合成雄激素的3种酶活性受到严重影响，以致睾丸不能正常地产生雄激素和精子。咖啡因对于生精细胞来说是一种有害物质，应避免。同样，也不要饮含有咖啡因的可乐和浓茶等饮料。
3、避免不良生活习惯
不规律的生活，如经常熬夜等精液中精子质量可能下降，应当避免。避免久坐，因为阴囊内的温度比体内温度低2℃-3℃，而久坐会升高阴囊内温度，不利于精子发育。对长时间静坐工作的白领、长途驾驶员和喜欢穿紧身裤的人，应该穿宽松的内裤，定时起立或下车活动。若有些人阴囊表面温度较高，可以在晚上用冷水贴敷阴囊，以适当降低阴囊的温度，这样更有利于精子的产生。
4、充分而均衡的营养
注意补充蛋白质、锌等。
5、性生活因素
改善不良性生活习惯，注意性生活频度。
药物治疗
1、激素治疗
（1）促性腺激素释放激素（GnRH）：促进男性身体产生激素以保障精子的正常产生。
（2）hCG（人绒毛促膜性腺激素）和hMG（人绝经后尿促性腺激素）联合治疗。
（3）溴隐亭和卡麦角林：如果男性体内催乳素水平太高，会阻止男性激素释放和精子产生，澳隐亭和卡麦角林能降低催乳素水平。
（4）其他：枸橼酸氯米芬、他莫昔芬。
2、抗生素
如头孢或者喹诺酮类抗菌药，可以杀菌，对抗感染。
3、其他
补充维生素E、维生素C、锌等。
手术治疗
1、有精索静脉曲张者应及时行精索静脉高位结扎术。
2、为预防以后可能出现的无精子症，隐睾症患儿应在2岁前施行睾丸固定术。
3、阴囊脂肪过多症患者可切除过多脂肪。
4、手术治疗睾丸鞘膜积液及腹股沟疝。
5、矫正生殖器异常，如尿道下裂、尿道上裂、尿道狭窄等矫正手术。
6、附睾输精管吻合术，适用于附睾尾部阻塞病变，附睾头部较饱满无硬结，睾丸及附睾活检示曲细精管生精功能良好，附睾管内有精子，输精管造影或注水试验证明输精管通畅者，可采用显微外科技术进行手术。
心理治疗
中国传统的“不孝有三，无后为大”的观念给许多不育症患者带来了沉重的社会压力。而这种社会压力既促使患者“有病乱投医”，又带来了相应的心理疾病。对于男性不育的患者除了应当查明病因和有针对性地进行治疗外，在心理上应该进行相应的疏导和治疗。告诉患者对待不育症要有耐心，因为睾丸制造精子需要一个过程，一般从精原细胞演变成精子大约需要74天，精子从睾丸排出后又要在附睾中经过18天左右的成熟过程才能排出体外。所以，即使药物有效也要在3个月后才能显效。治疗不育症常以3个月为疗程，频繁换药对治疗是不利的。另外，情绪上的不稳定也可以造成生精功能和性功能的障碍。
其他治疗
辅助生殖技术目前成功率有限，价格较昂贵，夫妻双方应做好各项准备。
1、人工授精
是将精子以非性交方式送入女性生殖道，以使卵子和精子自然受精达到妊娠目的的技术。可以提取丈夫的精子进行人工授精，在丈夫不能提供精子时，夫妻双方可根据自身需求选择精子库的他人的精子。
2、试管婴儿
是我们经常听到的辅助生殖技术，字面意思上理解是在试管里培育婴儿，但这只是一个俗称，它的学称为体外受精-胚胎移植，即从不孕女性体内取出卵细胞，与精子在体外受精后培养至早期胚胎，然后再移植回女性子宫，使胚胎继续着床发育、生长成胎儿的过程。常规的试管婴儿治疗主要步骤包括：控制性超促排卵、穿刺取卵、精子处理、体外受精、胚胎体外培养、胚胎移植等。衍生技术包括：
（1）常规体外受精与胚胎移植（IVF-ET）：常规体外受精与胚胎移植是将不孕不育患者夫妇的卵子与精子取出体外，在体外培养系统中受精并发育成胚胎后，将优质胚胎移植入患者宫腔内，让其种植以实现妊娠的技术。
（2）卵细胞浆内单精子注射（ICSI）：卵细胞浆内单精子注射是在显微操作系统的帮助下，在体外直接将单个精子注入卵细胞浆内使其受精，然后进行胚胎移植的技术。
（3）植入前胚胎遗传学诊断（PGD）：植入前胚胎遗传学诊断是指在体外对配子和胚胎进行遗传学诊断，避免遗传病患儿出生的技术。当胚胎体外培养发育到6个-10个卵裂球时，通过显微操作技术取1个-2个卵裂球进行分子遗传学检查，或者胚胎发育到囊胚期时，取滋养外胚层细胞，将未携带遗传病的胚胎移植回子宫使女方妊娠，从而避免遗传病患儿的妊娠、出生。广义上还包括受精前配子的检测，如卵子取极体进行基因或染色体检测。
