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冠状动脉瘤病因分为先天性和后天性，先天性病变包括先天性冠状动脉发育异常、动脉壁坏死及变性等；后天性病变中冠状动脉粥样硬化为成人冠状动脉瘤最常见病因，川崎病为青少年冠状动脉瘤最常见的病因。其它可能因素包括一些炎性动脉疾病、结缔组织病、感染性疾病和医源性损伤等。
基本病因
1、先天性病变
先天性病变主要为先天性冠状动脉发育异常、某些原因所致动脉壁呈囊性坏死及变性等，可增加患冠状动脉瘤的风险。
2、后天性病变
（1）冠状动脉粥样硬化：冠状动脉粥样硬化导致冠脉内膜损伤、脂质沉着、纤维化包裹、钙化，这些病变使得血管弹性减弱、血管壁对血管内压力的耐受能力降低，导致血管易于扩张和动脉瘤形成。动脉粥样硬化处的慢性炎症也参与冠状动脉瘤的形成。
（2）介入治疗：介入治疗后，由于介入治疗仪器使用不当如引管过大，仪器操作不当如球囊扩张过大、支架断裂、血管壁对介入材料高反应性等都有可能增加冠状动脉瘤的发生。
（3）川崎病：急性川崎病时，血管内炎症明显，血管中膜弹力层破坏，平滑肌坏死，继而血管扩张，动脉瘤形成。
（4）其他：炎性动脉疾病、感染类疾病、结缔组织病等也可能并发冠状动脉瘤。
危险因素
1、冠状动脉粥样硬化患者患冠状动脉瘤的风险较正常人增大。
2、川崎病青少年患者患冠状动脉瘤的风险增大。
3、具有一些先天性疾病如肌纤维发育不良、动脉壁坏死及变性等的患者，会增加患冠状动脉瘤的风险。
4、高血压、高血脂、糖尿病患者可能会增加患冠状动脉瘤的风险。
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