造成前牙深覆盖的原因是上下颌（牙弓）矢状关系不调：即上颌前突伴下颌正常，上颌正常伴下颌后缩，上颌前突伴下颌后缩。临床上前牙深覆盖患者以下颌后缩畸形为主。上、下颌骨关系不调受遗传和环境等因素的影响，其中遗传因素是主导。

1、遗传因素

严重的骨骼畸形导致的前牙深覆盖往往是下颌发育过小或上颌发育过大，这些均受遗传因素的影响。前牙深覆盖患者的上下颌牙量常出现比例失调，表现为上颌牙量偏大。恒牙萌出顺序的异常也受到遗传因素的调控，例如上第一恒磨牙早于下第一恒磨牙萌出，或者上第二恒磨牙早于下第二恒磨牙或上尖牙萌出，均有可能造成远中错（牙合）和前牙深覆盖。此外，上前牙区额外牙、下切牙先天缺失也可导致前牙深覆盖。这些牙齿大小、数目异常所造成的错（牙合）受遗传控制。

2、环境因素

（1）局部因素：一些口腔不良习惯如长期吮拇、咬下唇等可造成上前牙唇倾、下前牙舌倾、拥挤，前牙深覆盖；继发的覆盖下唇习惯可加重畸形的发展。上乳磨牙尤其是第二乳磨牙的邻面大面积龋损或早失，会出现上第一恒磨牙前移，导致磨牙远中关系。此外，下唇局部的瘢痕组织压迫下前牙舌倾，出现前牙深覆盖，严重者还会造成下颌后缩畸形。

（2）全身因素：鼻咽部疾患例如慢性鼻炎、腺样体肥大等造成上气道狭窄而以口呼吸代之，逐渐形成口呼吸习惯。口呼吸时，头部上仰，下颌连同舌下垂、后退，久之形成下颌后缩畸形；由于上前牙唇侧和上后牙腭侧失去正常压力，而两侧颊肌被拉长压迫上牙弓，可形成上牙弓狭窄、前突、腭盖高拱。最终表现出前牙深覆盖、磨牙关系远中。全身疾病如钙磷代谢障碍、佝偻病等，肌肉及韧带张力弱，引起上牙弓狭窄、上前牙前突和远中（牙合）关系。