原发性头痛的病因较为复杂，常常涉及遗传、饮食、内分泌以及精神因素等诸多方面。继发性头痛是继发于其他疾病的一种症状，往往存在明确的病因。

1、颅脑病变

（1）感染：如脑膜炎、脑膜脑炎、脑炎、脑脓肿等。

（2）血管病变：如蛛网膜下腔出血、脑出血、脑血栓形成、脑栓塞、高血压脑病、脑供血不足、脑血管畸形、风湿性脑脉管炎和血栓闭塞性脑脉管炎等。

（3）占位性病变：如脑肿瘤、颅内转移瘤、颅内囊虫病或棘球蚴病等。

（4）颅脑外伤：如脑震荡、脑挫伤、硬膜下血肿、颅内血肿、脑外伤后遗症等。

（5）其他：如偏头痛、丛集性头痛、肌收缩性头痛、头痛型癫痫、腰椎穿刺后及腰椎麻醉后头痛等。

2、颅外病变

（1）颅骨疾病：如颅底凹入症、颅骨骨折、颅骨肿瘤等。

（2）颈部疾病：如颈椎病及其他颈部疾病。

（3）神经痛：如三叉神经、舌咽神经及枕神经痛等。

（4）其他：如眼、耳、鼻和齿等疾病和治疗所致的头痛，例如鼻窦感染、磨牙或根管时产生的疼痛。

3、全身性疾病

（1）急性感染：如流感、伤寒、肺炎等发热性疾病。

（2）中毒：如铅、酒精、一氧化碳、有机磷、药物（如颠茄、水杨酸类）等中毒。

（3）其他：高血压病、心力衰竭、尿毒症、低血糖、贫血、肺性脑病、系统性红斑狼疮、月经期或绝经期头痛、中暑等。

4、精神心理因素如抑郁、焦虑、神经衰弱及癔症性头痛。

5、其他因素如酒精、咖啡因或其他药物的使用或戒断、体内神经递质的水平变化、高原反应等。