医生一般依据蘑菇的摄入史、临床表现及靶器官损害证据，可作出蘑菇中毒的临床诊断。时间窗内的血、尿、呕吐物、体液等样本中检测到相应的蘑菇毒素可确定诊断。此外，在诊断过程中，医生还需排除急性胃肠炎、细菌性痢疾、霍乱等疾病。

诊断依据

1、病史

明确的蘑菇食用史，最好能提供蘑菇实物或照片等直接证据。

2、群体发病

同食者出现相似症状。

3、临床表现

依据蘑菇种类，蘑菇中毒潜伏期从数分钟到十余天不等，初始可以是恶心、呕吐、腹痛、腹泻等消化道症状，患者也可出现幻听等精神症状，以及肝、肾等实质器官功能损害的表现。

4、辅助检查

血、尿、呕吐物、早期体液标本中检测到蘑菇毒素等可确诊。

鉴别诊断

1、急性胃肠炎

急性胃肠炎是常见的内科疾病，起病前多有不当的饮食史或用药史，如进食过多生冷、粗糙或刺激性食物，或服用某些对胃肠黏膜有刺激性的药物。起病急骤，患者可表现为上腹不适或疼痛、恶心、呕吐及食欲不振，伴肠炎者则有腹泻等表现。结合病史、毒素检测等，一般不难诊断。

2、细菌性痢疾

细菌性痢疾是由痢疾杆菌引起的肠道传染病，主要表现为腹痛、腹泻、里急后重、排黏液脓血便等，常伴有发热及全身毒血症状。结合毒蘑菇食用史、症状和毒素检测等可以鉴别二者。

3、霍乱

霍乱是由霍乱弧菌引起的烈性肠道性传染病，常急性起病，典型表现为剧烈腹泻，多伴呕吐、脱水、电解质紊乱和肌肉痉挛等，严重者还可发生循环衰竭，甚至死亡。结合病史和辅助检查即可进行鉴别。

1、根据累及的器官及临床表现分类

可分为急性肝损伤型、急性肾衰竭型、溶血型、横纹肌溶解型、胃肠炎型、神经精神型、光过敏性皮炎型及其他损伤类型。也有学者将其分为胃肠炎型、神经精神型、溶血性和中毒性肝炎型。

2、根据病情分级评分（HOPE6评分及TALK评分）分类

可分为致死性蘑菇中毒和非致死性蘑菇中毒。